超聲波細(xì)胞粉碎機(jī)

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技術(shù)知識(shí)

使用超聲波細(xì)胞粉碎機(jī)可以有效提高測(cè)序文庫的構(gòu)建效率

來源:上海凈信     發(fā)布時(shí)間:2022-12-09    作者:超聲波設(shè)備

  傳統(tǒng)的DNA斷路器(即斷路器)主要是接觸斷路器,在安全性、精度、反應(yīng)效率、反應(yīng)邊界條件和反應(yīng)均勻性方面存在一些不足,難以滿足實(shí)驗(yàn)類型的多樣性、安全性、多病毒交叉感染的要求。

  超聲波細(xì)胞粉碎機(jī)采用非接觸式超聲波破碎技術(shù),適用于有特殊需要的反應(yīng)系統(tǒng)。與傳統(tǒng)的中斷器相比,它在安全性、精度、反應(yīng)效率、反應(yīng)邊界條件和反應(yīng)均勻性方面具有突出的優(yōu)勢(shì)CHIP研究平臺(tái)(染色質(zhì)免疫共沉淀)標(biāo)準(zhǔn)化工具。

SZ-IID.jpg

  儀器包括:二價(jià)陽離子,隨機(jī)DNA存在雙鏈結(jié)合蛋白、非離子表面活性劑和單價(jià)鹽,DNA分子被打斷??捎行岣邷y(cè)序文庫的建設(shè)效率。

  DNA分子的雙螺旋結(jié)構(gòu)是由兩個(gè)長(zhǎng)長(zhǎng)的脫氧核苷酸鏈通過內(nèi)部氫鍵形成的堿基穩(wěn)定平行連接,進(jìn)一步改善了堿基對(duì)之間的縱向相互作用DNA因此,分子的穩(wěn)定性DNA雙螺旋分子結(jié)構(gòu)是一種相對(duì)穩(wěn)定的結(jié)構(gòu)。

  高通量測(cè)序(NGS)隨著科學(xué)研究、診斷和體檢技術(shù)的發(fā)展和成熟,其應(yīng)用范圍不斷擴(kuò)大。除市場(chǎng)擴(kuò)張外,測(cè)序技術(shù)本身的發(fā)展也有所放緩,制約技術(shù)擴(kuò)張和應(yīng)用的瓶頸也逐漸顯現(xiàn)。

  如今,NGS為了縮短時(shí)間,增加通量,樣品制備的瓶頸效應(yīng)越來越明顯。同時(shí),不斷開發(fā)新的方法來處理較少的樣品起始量等。

  目前常用的脫氧核糖酸(以下簡(jiǎn)稱脫氧核糖核酸)DNA)分子片段化有四種方法,即DNA限制性酶切割、流體力學(xué)切割、超聲破碎和噴霧霧化各有優(yōu)缺點(diǎn)。

  長(zhǎng)鏈DNA(通常稱為生物染色體DNA)短片段的主要原因是DNA片段有利于DNA分子的快速雜交和高靈敏度的目標(biāo)檢測(cè),而片段是NGS文庫建設(shè)過程中不可避免的過程。

  使用機(jī)械方法,該區(qū)域?qū)⒕哂胁煌谄渌麉^(qū)域的斷裂比(概率),從而在一定程度上引入機(jī)械中斷的偏好。采用低成本非限制性內(nèi)部切割酶法,擺脫了中斷儀器的限制,建立了一般分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室和高通量實(shí)驗(yàn)室NGS實(shí)驗(yàn)室文庫建設(shè)DNA中斷方法。

  超聲波細(xì)胞粉碎機(jī)是一種基于流體力學(xué)剪切和超聲壓裂的破碎方法DNA推薦的分子破碎方法。另外,由于DNA甲基化修飾等分子本身的特異性會(huì)提高分子本身的特性。


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