【導(dǎo)讀】:“超聲波破碎/裂解細(xì)胞的常見(jiàn)問(wèn)題知多少?”有許多客戶(hù)反映超聲波破碎和裂解細(xì)胞遇到很多問(wèn)題,今天就由小編來(lái)為大家介紹下超聲波破碎/超聲波裂解細(xì)胞的常見(jiàn)問(wèn)題,讓超聲波細(xì)胞破碎儀在您的手中使用的得心應(yīng)手!
大腸桿菌表達(dá)外源蛋白,在超聲破碎的時(shí)候,用含有1%triton-X-100的PBS懸浮,然后超聲的效果較好,1%triton-X-100的作用還是比較容易看到的,對(duì)其他的一些微生物同樣起作用,比如鏈霉菌。
微生物沉淀直接加樣品1buffer,再加5ul的巰基乙醇,混勻,離心,煮沸10min,直接上樣,染色脫色步驟如下:將膠放入適量的染色液微波爐里加熱1min(下次適當(dāng)補(bǔ)點(diǎn)醋酸),將染色液換成大量的水(自來(lái)水)在微波爐煮10min就可以。
在表達(dá)重組蛋白后超聲波破碎細(xì)胞,采用冰浴,400w,破2s停1s,但是不一會(huì)就產(chǎn)生大量泡沫,影響了破碎功率,pbs和tris緩沖液都是這樣,都是破碎不徹底,而我的目的蛋白也在這些未破碎的細(xì)胞中。
1*會(huì)產(chǎn)生氣泡是因?yàn)槟愕奶筋^位置沒(méi)放好。探頭要接近底部,約1cm(我一般是距底部0.5mm)。功率根據(jù)儀器不同會(huì)有所不同,但你可以觀察液面,有波動(dòng)但不要太劇烈就好。
2*破3S停10S,破個(gè)二三十次看看。
3*變幅桿位置擺放也要注意,聽(tīng)聲音如果不對(duì)的話就要及時(shí)調(diào)整。另外可以從菌濃度方面考慮。在破碎時(shí)試著加大體積,強(qiáng)度但不要多于60%.
4*嘗試走8s停8s,對(duì)有些菌體蛋白來(lái)說(shuō),你的方法很難散熱,導(dǎo)致蛋白變性產(chǎn)生氣泡,可以讓停頓時(shí)間稍長(zhǎng)一些,這種情況多見(jiàn)于包涵體形式的蛋白。
鏈霉菌(放線菌)超聲破碎的,用的方法條件是什么?前處理一般就是配置成某濃度的菌懸液。使用超聲破碎時(shí)采用的具體條件是:
(1)取菌的24h培養(yǎng)液于5000r/min下離心5min收集菌體.
(2)用pH7.5的Na2HPO-NaH2PO緩沖液洗滌3次,再用該緩沖液將菌體配成1:3的菌懸液.置于40mL大塑料試管內(nèi).
(3)將大塑料試管置于冰浴中,采用超聲波破碎(功率200W,1/2”探頭,破碎30s,間歇30S).
(4)破碎液于12000r/min下高速冷凍離心30min,收集細(xì)胞碎片和上清夜.
超聲破菌流程與上述基本一致,就是洗滌菌體也可以用預(yù)冷的生理鹽水或pH8的Tris-HCl,洗滌一下就可以。另外,超聲劑量隨樣品量、菌體改變比較大,功率可以到400-600w,走5s,停5s,冰浴,要加終濃度1mM的PMSF。為選取合適的超聲強(qiáng)度和次數(shù),需要多多鏡檢觀察菌體是否徹底破碎。
放線菌屬于原核生物系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)上的(G+C)摩爾百分含量(mol%)高的革蘭氏陽(yáng)性菌(Eubacteria)分枝類(lèi)群,它雖然具有原核生物特有的分子生物學(xué)特性,但在其不同類(lèi)群中,細(xì)胞壁的化學(xué)組分變化很大。
在做大腸桿菌超聲時(shí),采用的是400W,走5停5的方法,效果不錯(cuò),但是用在鏈霉菌上,似乎沒(méi)什么效果。會(huì)不會(huì)就是由于細(xì)胞壁組成差異造成的呢,因?yàn)榇竽c桿菌式屬于革蘭氏陰性菌的。
再有鏡檢是檢驗(yàn)破碎效果,但是細(xì)胞破碎程度和我需要的酶獲得之間有正比關(guān)系嗎?破碎時(shí)間長(zhǎng)也會(huì)影響到酶的活性。所以想問(wèn)問(wèn)anaisai戰(zhàn)友,你提供的“功率200W,1/2”探頭,破碎30s,間歇30S”的條件好像是用于破碎鏈霉菌孢子的,也可以用于發(fā)酵離心后的菌泥嗎?如果可以,你破碎的時(shí)間大概是多少呢?
如果你需要的是胞內(nèi)酶,細(xì)胞破碎程度和需要的酶獲得之間基本上有正比關(guān)系。破碎時(shí)間長(zhǎng)的確會(huì)影響到酶的活性。這就需要在較佳的破碎時(shí)間和酶活性之間做出判斷,比較直接的辦法是先繪制相關(guān)曲線(酶活性和時(shí)間的關(guān)系曲線)。
實(shí)驗(yàn)中,破碎的是棒狀桿菌(也是很難破壁的G+菌),破碎時(shí)間控制在30min左右,酶活較好。如果是基質(zhì)菌絲的話,好可以考慮用溶菌酶處理一下.一般來(lái)講這幾種方法讀可以的:
一,液氮研磨
二,用frenchpress破碎
三,超聲波破碎
四,溶菌酶處理預(yù)處理
超聲波是物質(zhì)介質(zhì)中的一種彈性機(jī)械波,它既是一種波動(dòng)形式,又是一種能量形式。超聲對(duì)細(xì)胞的作用主要有熱效應(yīng),空化效應(yīng)和機(jī)械效應(yīng)。熱效應(yīng)是當(dāng)超聲在介質(zhì)中傳播時(shí),摩擦力阻礙了由超聲引起的分子震動(dòng),使部分能量轉(zhuǎn)化為局部高熱(42-43℃)。空化效應(yīng)是在超聲照射下,生物體內(nèi)形成空泡,隨著空泡震動(dòng)和其猛烈的聚爆而產(chǎn)生出機(jī)械剪切壓力和動(dòng)蕩。另外,空化泡破裂時(shí)產(chǎn)生瞬時(shí)高溫(約5000℃)、高壓(可達(dá)500×104Pa),可使水蒸氣熱解離產(chǎn)生.OH自由基和.H原子,由.OH自由基和.H原子引起的氧化還原反應(yīng)可導(dǎo)致多聚物降解、酶失活、脂質(zhì)過(guò)氧化和細(xì)胞殺傷。機(jī)械效應(yīng)是超聲的原發(fā)效應(yīng),超聲波在傳播過(guò)程中介質(zhì)質(zhì)點(diǎn)交替地壓縮與伸張構(gòu)成了壓力變化,引起細(xì)胞結(jié)構(gòu)損傷。損傷作用的強(qiáng)弱與超聲的頻率和強(qiáng)度密切相關(guān)。
100g大腸桿菌溶于1L破碎液里(破碎掖:50mMTris-Cl(PH8.5)5mMEDTA0.14MNaCl),攪拌,發(fā)現(xiàn)菌液發(fā)粘,菌體不能夠迅速分散,用高壓勻質(zhì)機(jī)破碎,加壓后,菌液不能進(jìn)入勻質(zhì)機(jī),速度很慢,請(qǐng)問(wèn)是何原因?能有好的辦法解決,用勻質(zhì)機(jī)快速破碎菌體?將破碎液的量加大,也做不到可能是量太大。超聲處理5-10分鐘,菌液粘度會(huì)大大降低,也可促進(jìn)菌體分散。
不同型號(hào)的設(shè)備功率不一樣,功率的大小決定了使用變幅桿的大小范圍(直徑2mm至幾十毫米),你使用多大的變幅桿就在設(shè)備的上調(diào)至該刻度(很簡(jiǎn)單的)!變幅桿的大小決定了處理量5ml一下選3mm,5~50ml可選6~8mm,50ml以上選10mm的變幅桿,依此類(lèi)推!占空比不用關(guān)心的,主要是指超聲時(shí)間和停頓時(shí)間的比值。
酵母破碎的問(wèn)題
一般的PROTOCOL都是用glassbeads破碎酵母細(xì)胞sigmaG-8772酵母破碎效果好的我所做過(guò)的方法中還是玻璃珠,效率很高,而且對(duì)目的蛋白活性不會(huì)有什么影響。一般應(yīng)該用這個(gè)方法。
化學(xué)裂解的方法,10g酵母加1ml的乙酸乙酯,攪拌至液體狀。此法的裂解效果不錯(cuò)的加尿素裂解液(尿素8mol/L,NaCl0.5mol/L,Tris20mmol/L,EDTA20mmol/L,2%SDS,PH值8.0),據(jù)說(shuō)效果可以。
畢氏酵母細(xì)胞破碎法
在破碎遇到的問(wèn)題是菌體濃度太低,OD620nm在4-6之間。細(xì)胞破碎儀的低破碎體積為4ml左右,這樣再稀釋一倍,OD就到2-3啦,我們懷疑破碎完溶出蛋白和酶活測(cè)定時(shí)會(huì)測(cè)不準(zhǔn)。所以請(qǐng)教大家細(xì)胞破碎時(shí)低菌濃多少為下限?我們的菌是一種棒桿菌。破碎后,你可將液體放入透析袋中濃縮。
我們所做的方法是按照1:20的比例將離心后的菌體(e.coli)溶解于超聲緩沖液(50mM磷酸pH8.0)300w10s/10s破碎20分鐘。做了鏡檢!基本全被破碎了!我做蛋白純化的,做的包涵體。實(shí)驗(yàn)中我們的菌體濃度相對(duì)獨(dú)立,與培養(yǎng)液中的菌體od無(wú)關(guān),不收其限制,便于操作者調(diào)控。
一般按每g濕菌體加5-10ml裂菌緩沖液。超聲會(huì)產(chǎn)熱,所以需要有降溫裝置,或者你需要得成分耐高溫。(超聲波裂解器,超聲波裂解器廠家,凡帝朗超聲波裂解器,超聲波裂解器價(jià)格)
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